These summaries were manually compiled by Amir Mishalia mishalia@cs.bgu.ac.il and Nir Esterman esterman@cs.bgu.ac.il . The scores, pdb names and the SCOP codes listed may contain errors. Despite efforts to obtain the most accurate information in these summaries, errors may appear and we assume no responsibility regarding the contents listed. However, if you find errors or typos in the below information, please e-mail Nir, Amir and/or Dani Fischer dfischer@cs.bgu.ac.il and we would be more than happy to correct them.
| Fold | Number of servers in which fold was found | Number of times fold was found | Number of times fold found at rank 1 | Number of times fold found within ~10% of threshold | selected server/pdb | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
2.28
| 6
| 10
| 1
| 0
| 2.1
| 6
| 9
| 1
| 0
| 2.44
| 7
| 8
| 2
| 0
| 2.40
| 5
| 6
| 3
| 0
| 4.13
| 4
| 4
| 0
| 0
| 2.9
| 3
| 5
| 1
| 0
| 2.38
| 3
| 4
| 1
| 0
| 2.2
| 2
| 2
| 0
| 0
| |
| SERVER NAME | HIT1 | S1 | HIT2 | S2 | HIT3 | S3 | HIT4 | S4 | HIT5 | S5 | List of top 5 pdb codes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB-BLAST <0.1 | 2.11.1
3.64.1
| 4.6
|
5.11.1
| 6.1
|
5.11.1
| 6.1
|
1c1h
| 8.0
| 1fji
| 8.0
| 1gpl | 1bjt 1bgw 1c1hA 1fji FFAS | >8.0
1dswA
| 4.87
|
2.1.8
| 4.86
|
2.1.8
| 4.80
|
1.127.1 | 3.3.1 4.146.1 4.55
|
4.13.2
| 4.48
| 1dswA | 1xsoB 1srdD 1d4eA 1bt0A 3D-PSSM | <0.37
2.20.1
| 0.47
|
1qvcA
| 1.96
|
4.24.1
| 3.04
|
2.20.1
| 3.87
|
4.13.2
| 4.31
| 1knb | 1qvcA 1pbk 1kacA 1a5r GENTHREADER | >0.7
1.31.2 | 2.38.6 4.101.1 0.182
|
4.91.2
| 0.115
|
4.13.2
| 0.109
|
3.61.1
| 0.106
|
3.89.1
| 0.084
| 1b3qA3 | 3pyp 1vcbA 2admA 1atg m-GENTHREADER | >0.7
3.61.1
| 0.106
|
3.89.1
| 0.084
|
2.38.2
4.13.7
| 0.076
|
2.1.2
| 0.075
|
2.32.3
3.31.1
| 0.063
| 2admA | 1atg 3seb2 1ten 1lvk1 BIOINBGU(gonp) | >6.0
2.40.4
| 4.1
|
1an3
| 3.6
|
2.44.1
| 3.2
|
1ill
| 2.9
|
2.40.3
| 2.9
| 1wba | 1an3B 1ppbH 1illG 1jlx BIOINBGU(gonpm) | >6.0
2.6.1
| 3.7
|
2.28.1
| 3.4
|
2.40.4
| 3.3
|
2.5.1
| 3.3
|
2.72.1
| 3.1
| 3rpb | 2ltnA 1wba 1cur 1vmoA BIOINBGU(seqpprf) | >7.0
1cda
| 3.8
|
1ill
| 3.3
|
2.1.1
| 3.3
|
2.21.1
| 3.1
|
2.44.1
| 3.1
| 1cdaA | 1illG 1qg3A 1tnfA 2snv BIOINBGU(seqpmprf) | >7.0
2.44.1
| 3.7
|
2.1.1
2.17.1
2.64.1
| 3.6
|
2.1.7
| 3.5
|
2.2.3
| 3.4
|
2.73.1
| 3.3
| 2snv | 1gof 1akp 1amx 1b2p BIOINBGU(prfseq) | >6.0
2.28.1
| 3.6
|
2.28.1
| 3.6
|
2.3.3
| 3.5
|
2.73.1
| 3.5
|
2.44.1
| 3.4
| 2ltnA | 1qmoE 2pabA 1b2pA 2snv BIOINBGU(consensus) | >12.0
2.40.4
| 6.0
|
2.44.1
| 5.8
|
2.28.1
| 5.6
|
1cdaA
| 3.9
|
2.6.1
| 3.7
| 1wba | 2snv 2ltnA 1cdaA 3rpb SAM-T99 | <0.01
2.9.1
| 1.93
|
2.9.1
| 2.17
|
3.47.1
| 15.11
|
2.38.4 | 4.87.1 15.73
|
2.38.4 | 4.87.1 15.89
| 1vpsB | 1vpsA 1cfr 1aszB 1asyA FUGUE | >6
2.1.2
| 3.28
|
7.18.1
| 2.87
|
1.31.1
| 2.75
|
2.46.2 | 3.1.5 2.71
|
2.1.1
| 2.69
| 1fnf4 | 1vvd 1nkd 1bd0A 1qfhA P-MAP | <0.05
3.16.4
| 2.36
|
3.16.4
| 2.84
|
3.16.4
| 2.91
|
6.4.3
| 3.02
|
3.16.4
| 4.20
| 1czkA | 1czoA 1czlA 5prn 1czrA SAUSSAGE | n.a
1.60.11 | 3.7.1 2.33
|
5.17.1
| 2.32
|
1.72.1
| 2.28
|
1.110.2
| 2.21
|
1.123.1
| 2.14
| 1zymA | 1dkzA 1aisB 1bd8 1qq8A ssPsi | n.a. 2.44.1
| 648
| 2.9.1
| 632
| 2.28.1
| 629
| 2.9.1
| 623
| 2.44.1
| 623
| 1hagE | 1bmv2 1azdA 1vpnA 1sgt RPFOLD | n.a. 2.25.1
| 73.35
| 2.28.1
| 73.11
| 4.48.7
| 72.86
| 2.28.1
| 72.81
| 2.28.1
|
| 1qu5A | 1xnc 3sxlA 1xnb 2bvvA LOOPP | n.a. 2.40.3
| 3.2
| 3.40.1
| 3.0
| 2.11.1 | 3.64.1 2.9
| 3.92.1
| 2.8
| 2.44.1
| 2.8
| 1jlxA | 1vhrA 1gpl 1ctt 5ptp THREADWITHSEQ | n.a. 2.5.1
| 0.82
| 2.28.1 | 2.63.1 0.80
| 2.28.1
| 0.71
| 2.40.1
| 0.70
| 3.1.2
| 0.54
| 1a3z | 1kit 2ayh 1ilr1 1pii 123D+ | n.a. 4.101.1
| 581
| 3.46.1
4.87.1
| 567
| 2.1.6
| 518
| 2.9.1
| 499
| 2.2.2
| 489
| 1bxd | 1atiA1 1nciA 1bmv1 1aohA |