These summaries were manually compiled by Amir Mishalia mishalia@cs.bgu.ac.il and Nir Esterman esterman@cs.bgu.ac.il . The scores, pdb names and the SCOP codes listed may contain errors. Despite efforts to obtain the most accurate information in these summaries, errors may appear and we assume no responsibility regarding the contents listed. However, if you find errors or typos in the below information, please e-mail Nir, Amir and/or Dani Fischer dfischer@cs.bgu.ac.il and we would be more than happy to correct them.
| SERVER NAME | HIT1 | S1 | HIT2 | S2 | HIT3 | S3 | HIT4 | S4 | HIT5 | S5 | List of top 5 pdb codes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB-BLAST <0.1 | 1elr
| 0.028
|
2.1.1
| 2.1
|
2.1.1
| 2.1
|
1qfwH
| 4.8
| 4.91.2
| 4.8
| 1elrA | 1dlfH 2dlfH 1qfwH 2phy FFAS | >8.0
4.70.1
| 4.78
|
4.91.2
| 4.57
|
6.2.1
| 4.45
|
4.1.1
| 4.20
|
1.1.1
| 4.19
| 1dwnC | 3pyp 1be3K 1rds 1cioB 3D-PSSM | <0.37
1elw
| 8.05
|
1elr
| 8.76
|
1.1.1 | 2.41.1 3.18.1 11.7
|
1.12.1
| 12.0
|
1.7.1
| 12.0
| 1elwA | 1elrA 1cqxA1 1kdxA 2spcA GENTHREADER | >0.7
2.49.2 | 4.27.1 0.091
|
1.4.1
| 0.090
|
1.31.1
| 0.086
|
4.91.2
| 0.063
|
1.12.1
| 0.061
| 1qcsA2 | 1mbg 1nkd 3pyp 1kdxA m-GENTHREADER | >0.7
2.38.2
| 0.289
|
1.4.1
| 0.115
|
7.8.1
| 0.110
|
2.49.2 | 4.27.1 0.072
|
3.42.1
| 0.067
| 1prtF | 1bw6A 1tocR1 1qcsA2 1a8l1 BIOINBGU(gonp) | >6.0
1.1.1
| 3.4
|
1.25.8
| 3.2
|
1.25.3
| 3.0
|
1.1.1
| 2.8
|
1.35.1 | 1.36.1 2.7
| 1flp | 1avoB 1bbh 3sdh 1b0nA BIOINBGU(gonpm) | >6.0
1.20.1
| 3.1
|
1.25.8
| 2.9
|
1.35.1 | 1.36.1 2.7
|
8.2.2
| 2.4
|
1.7.2
| 2.4
| 1bmfG | 1avoB 1b0nA 1ebo 1br0 BIOINBGU(seqpprf) | >7.0
1.25.9
| 4.0
|
1.25.7 | 4.24.1 3.3
|
8.2.2
| 3.2
|
1.25.8
| 3.1
|
1.12.1
| 3.1
| 1a0b | 1fap 1env 1avoB 1kdx BIOINBGU(seqmprf) | >7.0
1.25.9
| 4.2
|
1.110.8
| 3.3
|
8.2.2
| 3.3
|
1.3.1
| 3.1
|
1.4.1
| 3.1
| 1a0b | 1a17 1env 1fcdC 1bl0 BIOINBGU(prfseq) | >6.0
1.11.1
| 3.2
|
1.35.1 | 1.36.1 3.2
|
8.2.2
| 2.9
|
1.1.1
| 2.7
|
1.1.1
| 2.7
| 1aca | 1b0nA 1qbz 1cg5B 1flp BIOINBGU(consensus) | >12.0
1.25.9
| 8.2
|
1.25.8
| 4.1
|
1.1.1
| 3.9
|
1.20.1
| 3.3
|
1.35.1 | 1.36.1 3.2
| 1a0b | 1avoB 1flp 1bmfG 1b0nA SAM-T99 | <0.01
1d7eA
| 11.66
|
4.91.2
| 12.51
|
4.91.2
| 12.51
|
4.91.2
| 12.51
|
4.91.2
| 12.51
| 1d7eA | 2phy 2pyp 2pyr 3phy FUGUE | >6
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| | P-MAP | <0.05
2.1.1
| 7.87
|
1d7e
| 13.1
|
4.91.2
| 13.7
|
3.13.1
| 20.1
|
3.13.1
| 31.2
| 2dlfH | 1d7eA 2phy 1iceA 1ibcA SAUSSAGE | n.a
4.147.1
| 2.41
|
3.39.1
| 2.29
|
1.41.1
| 2.24
|
4.132.1
| 2.03
|
4.48.6
| 2.03
| 1tsg | 1dg9A 1wdcC 1apyB 1npk ssPsi | n.a. 4.37.1
| 453
| 1.41.1
| 434
| 1.69.1 | 2.46.1 3.31.1 428
| 4.141.1
| 424
| 1.141.1
| 424
| 1aipC | 1a2xA 1bmfA1 1aihA 2sas RPFOLD | n.a. 1.25.3
| 74.63
| 4.5.1
| 73.49
| 4.5.1
| 73.25
| 7.18.1
| 73.18
| 7.17.1
| 73.15
| 1a7vA | 1c0bA 1a5p 1hfh 1b8mB LOOPP | n.a.
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| | |